Построен в 1855—1856 годах (Э. И. Тотлебен), перестроен в 1869—1879 годах (К. Я. Зверев).
Дмитрий Алексеевич Милютин, военный министр

Форт назван в честь Генерал-адъютанта Милютина, Дмитрия Алексеевича (1816—1912), соратника Александра Второго в проведении прогрессивных преобразований, доктора истории, председателя Военного совета, члена-корреспондента и почётного члена Императорской Академии Наук, почётного члена Михайловской военной академии, в бытность которого Военным министром производились преобразования военного ведомства и модернизация фортов Кронштадта (1861—1881).

Именно в это время происходил переход от гладкоствольной артиллерии к артиллерии нарезной, что существенно увеличило дальность стрельбы и повлекло изменение тактики боя. На форту, впервые в русской фортификации, орудия были установлены в башнях, хотя и весьма несовершенных по конструкции. Поводом для этого новшества был эпизод боя североамериканского «Монитора», вооружённого двумя орудиями во вращающейся башне с плавучей батареей «Мерримак» южан, показавший перспективность башенной установки пушек.

Здесь была установлена 6-ти башенная батарея, предназначенная для установки 11" орудия. (Внутренний диаметр башни 7,8 м, амбразура 70 х 115 см. Орудие выступало за габариты башни на 30 см, а его полный откат составлял 2,1 м. Бронирование башни обеспечивалось бронёй толщиной 30 см. Вес башни 500 т. Она должна была выдерживать прямое попадание вражеского снаряда). Для вращения башни и подачи снарядов служили паровые машины.